矯正後の噛み合わせ

上は2本抜歯、親知らずは4本抜歯して前側のワイヤーで約2年半ほど矯正をしていました。あと2回の通院で器具を外せると言われたのですが、噛み合わせがまったくと言っていいほど合っていません。
抜歯した隙間などもなく、歯並びは外側からみると綺麗になっています。しかし口をいーっとしたときに内側から舌で歯をなぞると奥歯から前歯まで舌が入るくらいの隙間があり外側からは見ても分からない噛み合わせになっています。
ご飯を食べる時もよく噛めていない気がします。元の歯並びも悪かったので、これが正しい噛み合わせなのかが分かりません。
かかりつけのお医者さんに話した時は、元々歯が内側に倒れていたのでそれを外側立て直したので、そうなってるといわれ、器具を外したら自然と噛み合わせも合うこともあると言われました。
本当にそうなるでしょうか?